病原体不同：感冒可以由多种病毒引起，如常见的鼻病毒、副流感病毒、冠状病毒、呼吸道合胞病毒等；流感仅由流感病毒引起。

流行情况不同：感冒和流感都是空气飞沫传播的，但是感冒多为散发；而流感常常突然发生，传播迅速，造成地区流行，有时甚至发生世界性大流行。

症状不同：普通感冒以鼻咽部症状为突出，如流涕、咳嗽、咽痛等，伴有或不伴有发热，引起普通感冒病毒多达100种以上，其病程通常为五到七日。

流行性感冒可见持续高热、畏寒、头痛、肌肉酸痛、明显疲乏等，而鼻咽部症状相对轻。流行性感冒的并发症有:肺炎，咳嗽加剧，痰多，气急气喘，有的人肺部有明显的细湿啰音或哮鸣音；病毒性心肌炎，心悸、胸闷、气透不过来；有心动过速，心脏早搏或其它心音低钝，心电图检查有异常。流感的病情一般较重，恢复较慢，易发生并发症，特别是儿童、年老及身体衰弱者，可因并发症而死亡。

治疗不同：感冒可服用维生素C、扑尔敏、伪麻黄碱、对乙酰氨基酚等对症治疗的药物；流感则需对症作抗病毒治疗。